數字PCR技術服務介紹

上海柏辰生物數字PCR技術服務——真正的高靈敏度微滴式數字PCR

QX200? Droplet Digital? PCR系統

　　微滴式數字PCR——Bio-Rad公司的QX200 PCR系統是能夠直接精準記錄DNA分子個數的第三代PCR。其原理是將含有核酸分子的反應體系分成上萬個微滴，每個微滴都是一個獨立的PCR反應體系，PCR反應后對每個微滴的熒光信號進行檢測，最終用專用分析軟件計算出待檢測樣品的絕對定量值。

服務項目


液態活檢——游離DNA檢測	拷貝數變異分析	稀有突變檢測	二代測序結果的精準驗證

低豐度病原微生物檢測	轉基因成分鑒定分析	微小差異基因或單細胞基因表達分析

技術優勢

● 痕量檢出

單分子水平擴增，微量DNA熒光信號不再被覆蓋。

● 絕對定量

直接提供濃度值（copeis/ul），不依賴擴增曲線、標準品。

● 高靈敏度

靈敏度高達0.001%。

● 高精確度

終點讀取熒光信號，可區分1.1倍差異。

● 高穩定性

受抑制劑影響很小，CV值小于5%。

上海柏辰已發表部分文章展示

突變檢測

Guo QM, Wang L, Yu WJ, Qiao LH, Zhao MN, Hu XM, Sun YM, Ni S, Xu YH, Lou JT. Detection of Plasma EGFR Mutations in NSCLC Patients with a Validated ddPCR Lung cfDNA Assay [J]. J Cancer, 2019, 10(18):4341-4349.

◆ 建立肺癌靶向用藥伴隨診斷檢測體系。

◆ 體系靈敏度低至0.1%。

定量檢測

Xunhua Zhu, Pengcheng Liu , Lijuan Lu , Huaqing Zhong , Menghua Xu , Ran Jia , Liyun Su , Lingfeng Cao , Yameng Sun , Meijun Guo , Jianyue Sun , Jin Xu. Development of a multiplex droplet digital PCR assay for detection of enterovirus, parechovirus, herpes simplex virus 1 and 2 simultaneously for diagnosis of viral CNS infections [J]. Virol J, 2022, 19(1):70.

◆ 腦脊液樣本中痕量拷貝病原感染檢測。

◆ 建立數字PCR四重檢測體系。

基因	檢測內容	臨床診斷
AR-V7	ar-v7剪切變異表達	前列腺癌
EGFR	19del（57種）、L858R、T790M、L861Q、G719S、S768I、G719X	肺癌等
	20ins【V769_D770insASV、D770_N771insG、H773_V774insNPH、N771_H773dup、D770_N771insSVD、S768_D770dup、A763_Y764insFQEA、H773_V774insH】
	T790M-C797S順反式
ALK	EML4-ALK(cDNA)：E13A20	肺癌等
	EML4-ALK(cDNA)：E20A20
	EML4-ALK(cDNA)：E6A20
BRAF	V600E	黑色素瘤等
ERBB2（HER2）	CNV	乳腺癌、胃癌等
KRAS	G12D、G12A、G12V、G12C、G12R、G12S、G13D、Q61H、Q61L等	肺癌、大腸癌等
MET	CNV	肺癌等
PIK3CA	E545K、E542K、H1047R等	乳腺癌、卵巢癌等

其余可檢測易感基因（液態活檢）：AKT1、ATM、BRCA1、BRCA2、CCDC6-RET融合、C-KIT、CD74-ROS1、CHEK1、EML4-ALK融合、ERBB2、FGFR3、FRY、IDH1、MET、NRAS、PALB2、PDGFRA、RAD51C、RAD54L、SLC34A2(E4)-ROS1(E32)、TP53TPM3-NTRK1融合等相關突變位點。